Ministerstvo odmieta, že by smernica 2001/18/ES Európskeho parlamentu bola transponovaná do nášho zákona č. 151/2002 Z. z. o používaní genetických technológií a geneticky modifikovaných organizmov nesprávne. Vzhľadom na to, že táto oblasť sa veľmi rýchlo vyvíja, tento rok sa pripravuje návrh nového zákona o používaní geneticky modifikovaných organizmov a genetických technológií. V súčasnej dobe prebiehajú právne analýzy. Ak sa odhalia nedostatky v transpozícií európskych smerníc, dôjde k ich odstráneniu.
V prípade nájdenia geneticky modifikovanej plodiny na Slovensku je možné vydať národný zákaz, ktorý by mal len dočasný charakter. Musia ho potvrdiť orgány EÚ, a pokiaľ by národný zákaz považovali za neopodstatnený a Slovenská republika by na ňom naďalej trvala, čakali by Slovensko postihy zo strany EÚ.